Soubory cookies jsou záznamy, které si webový prohlížeč ukládá po prokliku z affiliate linku. Právě na tomto základě funguje affiliate marketing. Po kliknutí na odkaz se vytvoří soubor cookie, který se uloží v prohlížeči, standardně na 30 dní. Po uplynutí této doby se automaticky vymažou a provize už publisherovi nepřísluší. Soubory cookies jsou údaje publishera, které zajišťují, aby byla publisherovi vyplacená provize. A to i v tom případě, když zákazník nenakoupí ihned, ale do e-shopu se vrátí až po několika dnech. Sledují tedy to, zda zákazník nakoupí po tom, co klikne na reklamu, a to z toho důvodu, aby byla publisherovi vyplacená provize.
